RCS – Atelier d’analyse des données d’ARN-seq
Le Réseau de cellules souches (RCS) est heureux de proposer à nouveau le populaire atelier sur l’analyse des données de séquençage de l’ARN (ARN-seq), qui comprendra des séances couvrant l’ARN-seq de masse (bulk) et l’ARN-seq à cellule unique. Pour pouvoir accueillir plus de participants, nous organisons en 2022 deux séries de séances d’atelier sur l’ARN-seq.
Dates des séances du 1er atelier : 5, 6 et 9 mai 2022
Dates des séances du 2e atelier : 26, 27 et 30 mai 2022
Endroit où se tiendront les ateliers : En ligne. Un lien vers les cours en ligne sera fourni aux demandeurs acceptés.
Date limite pour présenter une demande : mercredi 30 mars 2022.
Objectifs d’apprentissage de l’atelier
Par le biais d’une combinaison de cours interactifs et d’exercices en laboratoire informatique, les participants seront exposés à la filière d’acquisition et d’analyse des données d’ARN-seq et recevront une formation pratique sur l’analyse des réseaux et des voies de transmission des données « omiques » (formation axée sur les données d’ARN-seq, mais applicable aux données obtenues à partir d’autres plateformes telles que le séquençage ChIP, la micropuce ou la spectrométrie de masse).
Le cours fournira :
- une compréhension de base des technologies d’ARN-seq de masse et à cellule unique;
- une formation sur la manière de générer des listes de gènes différentiellement exprimés à partir de données brutes d’ARN-seq;
- une compréhension des différents tests statistiques utilisés pour analyser les ensembles de gènes;
- une expérience de l’utilisation des outils d’analyse de l’enrichissement de l’annotation fonctionnelle;
- une expérience en analyse des données d’ARN-seq à cellule unique.
L’atelier est organisé par William Stanford, Ted Perkins, David Cook et la Plateforme de bioinformatique d’Ottawa (Ottawa Bioinformatics Core Facility).
Qui devrait participer ?
Cet atelier d’analyse des données d’ARN-seq s’adresse aux biologistes des cellules souches (et autres utilisateurs finaux) qui cherchent à comprendre les concepts et processus bioinformatiques qui sont utilisés pour acquérir, analyser et interpréter les données d’ARN-seq de masse ou à cellule unique.
Procédure de demande
En raison de la nature interactive de cette formation en ligne, les places sont limitées. Les personnes intéressées doivent présenter une demande de participation à l’Atelier sur l’analyse des données d’ARN-seq avant le mercredi 30 mars 2022. Les demandeurs retenus seront informés avant le jeudi 7 avril 2022 et recevront des instructions sur la façon de s’inscrire à l’atelier.
- Veuillez remplir le formulaire de demande et le retourner par courriel, ainsi que de toute la documentation requise, à l’adresse earnold@stemcellnetwork.ca avant le mercredi 30 mars 2022, à 11 h 59 (heure du demandeur).
- Le Comité de formation et d’éducation du RCS examinera toutes les demandes remplies et les candidats seront informés des résultats du concours au cours d’ici le jeudi 7 avril 2022.
Questions
Pour toute question concernant cet atelier ou la demande d’inscription, veuillez vous adresser à Ellie Arnold, à l’adresse earnold@stemcellnetwork.ca.